Berikut adalah fasilitas yang tersedia di Pesantren Menara Al Qur’an, fasilitas-fasilitas tersebut insya Allah akan terus bertambah seiring waktu demi memenuhi kebutuhan serta kenyamanan santri.
- Masjid di setiap jenjang pendidikan
- Perpustakaan Bahasa Arab dan Indonesia
- Laboratorium Komputer
- Ruang kelas yang nyaman
- Asrama yang representatif